ポータブル燃料電池システムは、一般的に重量10kg以下、出力5kW以下に分類される。
小型燃料電池の潜在的な市場規模は非常に大きく、年率40％の潜在的成長率と約100億ドルの市場規模があるため、ポータブル電源電池の開発に多くの研究が割かれている。
この市場の中で、2つのグループが特定されている。
1つ目はマイクロ燃料電池市場で、小型電子機器の電源として1～50Wの範囲である。
2つ目は、より大規模な発電（軍事前哨基地や遠隔地の油田など）を目的とした1～5kWの発電機の市場である。
マイクロ燃料電池
主に携帯電話やノートパソコンの市場に浸透することを目指している。
これは、燃料電池がリチウムイオン電池よりもシステム全体でのエネルギー密度が高いことが主な理由です。
電池の場合は、電池本体に加えて充電器も含めてシステムとします。
燃料電池の場合は、電池本体と必要な燃料、周辺機器を含めたシステムとなる。
システム全体を考慮すると、リチウムイオン電池が44Wh/kgであるのに対し、燃料電池は530Wh/kgであることが示されている。
しかし、燃料電池システムの重量は明らかに有利であるが、現在のコストは有利ではない。
携帯電話の電力需要が増加すれば、燃料電池はより大きな電力を生み出す魅力的な選択肢となるだろう。
携帯電話やコンピュータの使用時間を長くしたいというのは、消費者からの要望でもあるので、燃料電池はノートパソコンや携帯電話の市場にも進出してくる可能性がある。
燃料電池の開発が加速するにつれ、価格は下がり続けるだろう。
マイクロ燃料電池の改良には、現在、カーボンナノチューブが使われている。
Girishkumarらは、ナノチューブを電極表面に堆積させることで、表面積が大幅に拡大し、酸素還元率が向上することを示している。
燃料電池を使ったポータブル電源システム
より大規模な活動に使用される燃料電池も大いに期待されている。
燃料電池を使ったポータブル電源システムは、レジャー分野（RV車、キャビン、船舶）、産業分野（ガス/石油の井戸、通信塔、セキュリティ、気象観測所などの遠隔地の電源）、軍事分野で使用することができる。
SFC Energyはドイツのメーカーで、様々なポータブル電源システム用のダイレクトメタノール型燃料電池を製造している。
Ensol Systems Inc.は、SFC EnergyのDMFCを使用したポータブル電源システムのインテグレーターである。
燃料電池の主な利点
この市場における燃料電池の主な利点は、重量あたりの発電量が大きいことである。
燃料電池は高価ではあるが、信頼できるエネルギーを必要とする遠隔地では、燃料電池は大きな力を発揮する。
72時間の旅行では、同じエネルギーを得るために29ポンドのバッテリーが必要なのに対し、燃料電池は15ポンドしかないため、重量の比較は非常に重要である。